故事发作在椚丘中学三年E班，外表上，这是一个普通的班级，但是实际上，这里聚集着的均是技艺高明冷漠无情的杀手。每一年，他们通过特殊渠道接纳着来自世界各地的暗杀义务，替各国首脑“排忧解难”，而这一次，他们有了一个统一的目的——刺杀班主任杀教员（福山润 配音）。杀教员是一个神奇的存在，它的外表并非人类，却有着及其敏感的神经和及其迅速的反响力，没有人知道它从哪里来，也没有人知道，它为何会变成三年E班的班主任。由于想要消灭地球，杀教员成为了暗杀名单上的低价悬赏人物，而作为三年E班的先生，只需成功消灭杀教员，即可毕业。就这样，围绕着这位奥秘的教员，充溢了危险的日常就此展开。